MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p6

Total Repeats: 7870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016588	GCC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016588	TCGG	2	8	52	59	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016588	CTG	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016588	GAA	2	6	120	125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016588	TCC	2	6	133	138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016588	GAG	2	6	187	192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016588	GAC	2	6	210	215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016588	CAG	2	6	228	233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016588	TGA	2	6	275	280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016588	GACC	2	8	299	306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016588	TGA	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016588	GCAAG	2	10	356	365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016588	AGC	2	6	439	444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016588	GC	3	6	491	496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016588	GCCG	2	8	504	511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016588	CGG	2	6	516	521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016588	CCGG	2	8	524	531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016588	CGGGG	2	10	548	557	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016588	ACC	2	6	580	585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999498
20	NC_016588	CGA	2	6	636	641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999498
21	NC_016588	CG	3	6	646	651	0 %	0 %	50 %	50 %	374999498
22	NC_016588	GCC	2	6	731	736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
23	NC_016588	GAT	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374999498
24	NC_016588	CCTG	2	8	777	784	0 %	25 %	25 %	50 %	374999498
25	NC_016588	CGA	2	6	840	845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999498
26	NC_016588	GGC	2	6	852	857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
27	NC_016588	CCG	2	6	861	866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
28	NC_016588	GGA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999498
29	NC_016588	CGC	2	6	912	917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
30	NC_016588	GCT	2	6	918	923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999498
31	NC_016588	CCG	2	6	972	977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
32	NC_016588	CGC	2	6	1005	1010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
33	NC_016588	CTG	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999498
34	NC_016588	GCC	2	6	1243	1248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
35	NC_016588	GGC	2	6	1260	1265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
36	NC_016588	GCGG	2	8	1281	1288	0 %	0 %	75 %	25 %	374999498
37	NC_016588	GCCG	2	8	1346	1353	0 %	0 %	50 %	50 %	374999498
38	NC_016588	CGG	2	6	1395	1400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
39	NC_016588	CTG	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999498
40	NC_016588	CCT	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999498
41	NC_016588	GGA	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999498
42	NC_016588	GCG	2	6	1467	1472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
43	NC_016588	CTT	2	6	1473	1478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999498
44	NC_016588	ACC	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999498
45	NC_016588	GCC	2	6	1561	1566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
46	NC_016588	GC	3	6	1578	1583	0 %	0 %	50 %	50 %	374999498
47	NC_016588	GGC	2	6	1584	1589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
48	NC_016588	GAC	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999498
49	NC_016588	CTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999498
50	NC_016588	GCCT	2	8	1645	1652	0 %	25 %	25 %	50 %	374999498
51	NC_016588	GCG	2	6	1689	1694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
52	NC_016588	TCG	2	6	1729	1734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999498
53	NC_016588	TGC	3	9	1781	1789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999498
54	NC_016588	CGG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
55	NC_016588	CGA	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999498
56	NC_016588	CGGG	2	8	1877	1884	0 %	0 %	75 %	25 %	374999498
57	NC_016588	CGGC	2	8	1902	1909	0 %	0 %	50 %	50 %	374999498
58	NC_016588	CCGG	2	8	1931	1938	0 %	0 %	50 %	50 %	374999498
59	NC_016588	CGA	2	6	1941	1946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999498
60	NC_016588	CGC	2	6	1973	1978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
61	NC_016588	GCGGCC	2	12	2031	2042	0 %	0 %	50 %	50 %	374999498
62	NC_016588	GGT	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999498
63	NC_016588	CCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999498
64	NC_016588	CCT	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999498
65	NC_016588	CCGG	2	8	2208	2215	0 %	0 %	50 %	50 %	374999498
66	NC_016588	CGA	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999498
67	NC_016588	TGA	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374999498
68	NC_016588	CAGC	2	8	2382	2389	25 %	0 %	25 %	50 %	374999498
69	NC_016588	GGC	2	6	2391	2396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
70	NC_016588	TCG	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999498
71	NC_016588	GCG	3	9	2437	2445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
72	NC_016588	CGG	2	6	2446	2451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999498
73	NC_016588	ACC	3	9	2498	2506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016588	ACG	2	6	2576	2581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999499
75	NC_016588	ACG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999499
76	NC_016588	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374999499
77	NC_016588	GGT	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999499
78	NC_016588	GTCG	2	8	2733	2740	0 %	25 %	50 %	25 %	374999499
79	NC_016588	TCG	2	6	2746	2751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999499
80	NC_016588	CG	3	6	2766	2771	0 %	0 %	50 %	50 %	374999499
81	NC_016588	CAG	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999499
82	NC_016588	ACA	2	6	2798	2803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374999499
83	NC_016588	CCA	3	9	2811	2819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999499
84	NC_016588	TCTGG	2	10	2859	2868	0 %	40 %	40 %	20 %	374999499
85	NC_016588	GAT	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374999499
86	NC_016588	CCCGA	2	10	2893	2902	20 %	0 %	20 %	60 %	374999499
87	NC_016588	GGC	2	6	2941	2946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999499
88	NC_016588	CCGGC	2	10	3034	3043	0 %	0 %	40 %	60 %	374999499
89	NC_016588	CGG	2	6	3054	3059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999499
90	NC_016588	TTC	2	6	3061	3066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999499
91	NC_016588	GC	3	6	3089	3094	0 %	0 %	50 %	50 %	374999499
92	NC_016588	CCG	2	6	3114	3119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999499
93	NC_016588	TAC	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999499
94	NC_016588	TCGA	2	8	3187	3194	25 %	25 %	25 %	25 %	374999499
95	NC_016588	CGA	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999499
96	NC_016588	GGC	3	9	3310	3318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999500
97	NC_016588	AGG	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999500
98	NC_016588	C	6	6	3341	3346	0 %	0 %	0 %	100 %	374999500
99	NC_016588	GGA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999500
100	NC_016588	GCT	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999500
101	NC_016588	GGA	2	6	3442	3447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999500
102	NC_016588	GTG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999500
103	NC_016588	GC	4	8	3473	3480	0 %	0 %	50 %	50 %	374999500
104	NC_016588	CGA	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999500
105	NC_016588	GCG	2	6	3502	3507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999500
106	NC_016588	CCG	2	6	3510	3515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999500
107	NC_016588	GCC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999500
108	NC_016588	GCC	2	6	3666	3671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999500
109	NC_016588	GCCG	2	8	3694	3701	0 %	0 %	50 %	50 %	374999500
110	NC_016588	GGCGA	2	10	3722	3731	20 %	0 %	60 %	20 %	374999500
111	NC_016588	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999500
112	NC_016588	CGG	3	9	3798	3806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999500
113	NC_016588	CGGG	2	8	3837	3844	0 %	0 %	75 %	25 %	374999500
114	NC_016588	CTG	3	9	3845	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999500
115	NC_016588	GTC	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999500
116	NC_016588	TGG	2	6	3878	3883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999500
117	NC_016588	GCCG	2	8	3919	3926	0 %	0 %	50 %	50 %	374999500
118	NC_016588	GCC	2	6	4023	4028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999500
119	NC_016588	CGGC	2	8	4033	4040	0 %	0 %	50 %	50 %	374999500
120	NC_016588	AGC	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999500
121	NC_016588	GCG	2	6	4109	4114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999500
122	NC_016588	GTCG	2	8	4117	4124	0 %	25 %	50 %	25 %	374999500
123	NC_016588	CTG	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999500
124	NC_016588	CTGG	2	8	4177	4184	0 %	25 %	50 %	25 %	374999500
125	NC_016588	ATC	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999500
126	NC_016588	GC	3	6	4223	4228	0 %	0 %	50 %	50 %	374999500
127	NC_016588	GCGGG	2	10	4238	4247	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016588	GC	3	6	4248	4253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016588	CGC	2	6	4257	4262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016588	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016588	CCG	2	6	4308	4313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016588	CG	4	8	4402	4409	0 %	0 %	50 %	50 %	374999501
133	NC_016588	GCCG	2	8	4427	4434	0 %	0 %	50 %	50 %	374999501
134	NC_016588	CGA	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999501
135	NC_016588	CTGGCC	2	12	4448	4459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374999501
136	NC_016588	GCC	2	6	4533	4538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999501
137	NC_016588	GTC	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999501
138	NC_016588	GGC	2	6	4645	4650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999501
139	NC_016588	GCC	2	6	4652	4657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999501
140	NC_016588	GCG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999501
141	NC_016588	CTG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999501
142	NC_016588	CCG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999501
143	NC_016588	TGC	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999501
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145	NC_016588	GCC	2	6	4941	4946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999501
146	NC_016588	GGA	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999501
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148	NC_016588	CGCC	2	8	5029	5036	0 %	0 %	25 %	75 %	374999501
149	NC_016588	CCG	2	6	5041	5046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999501
150	NC_016588	CGA	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999501
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152	NC_016588	GC	3	6	5095	5100	0 %	0 %	50 %	50 %	374999501
153	NC_016588	GAG	2	6	5201	5206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999501
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155	NC_016588	GGC	3	9	5242	5250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999501
156	NC_016588	CGG	2	6	5252	5257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999501
157	NC_016588	CGC	2	6	5304	5309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999501
158	NC_016588	GGCTG	2	10	5378	5387	0 %	20 %	60 %	20 %	374999501
159	NC_016588	TGG	2	6	5409	5414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999501
160	NC_016588	CCGA	2	8	5420	5427	25 %	0 %	25 %	50 %	374999501
161	NC_016588	CGC	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999501
162	NC_016588	GGA	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999501
163	NC_016588	GCCC	2	8	5484	5491	0 %	0 %	25 %	75 %	374999501
164	NC_016588	TC	3	6	5496	5501	0 %	50 %	0 %	50 %	374999501
165	NC_016588	CGG	2	6	5508	5513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999501
166	NC_016588	CGGCC	2	10	5520	5529	0 %	0 %	40 %	60 %	374999501
167	NC_016588	CG	3	6	5547	5552	0 %	0 %	50 %	50 %	374999501
168	NC_016588	GC	3	6	5606	5611	0 %	0 %	50 %	50 %	374999501
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172	NC_016588	GATCCT	2	12	5671	5682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374999501
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179	NC_016588	ACG	2	6	5805	5810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999501
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181	NC_016588	ATT	2	6	5847	5852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374999501
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183	NC_016588	ACG	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999501
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186	NC_016588	TGG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999501
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189	NC_016588	GCT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999501
190	NC_016588	TCCT	2	8	6212	6219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
191	NC_016588	CGA	2	6	6238	6243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999502
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252	NC_016588	CTG	2	6	8624	8629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999505
253	NC_016588	CAG	2	6	8639	8644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999505
254	NC_016588	G	6	6	8679	8684	0 %	0 %	100 %	0 %	374999505
255	NC_016588	TCCG	2	8	8702	8709	0 %	25 %	25 %	50 %	374999505
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264	NC_016588	GTT	2	6	9128	9133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374999505
265	NC_016588	CCCG	2	8	9178	9185	0 %	0 %	25 %	75 %	374999505
266	NC_016588	GAA	2	6	9218	9223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374999505
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268	NC_016588	TCG	2	6	9357	9362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999505
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270	NC_016588	CGG	2	6	9471	9476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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393	NC_016588	GATCCT	2	12	13733	13744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374999507
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396	NC_016588	GTC	2	6	13850	13855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999507
397	NC_016588	GGT	2	6	13898	13903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999507
398	NC_016588	GCT	2	6	13925	13930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999507
399	NC_016588	CAG	2	6	13965	13970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999507
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402	NC_016588	GC	3	6	14102	14107	0 %	0 %	50 %	50 %	374999508
403	NC_016588	GGC	2	6	14123	14128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999508
404	NC_016588	GC	3	6	14187	14192	0 %	0 %	50 %	50 %	374999508
405	NC_016588	CTG	2	6	14205	14210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999508
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412	NC_016588	AGG	2	6	14542	14547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999508
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420	NC_016588	CATCGA	2	12	14765	14776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374999508
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422	NC_016588	CAG	2	6	14862	14867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999508
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434	NC_016588	CGA	2	6	15202	15207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999508
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487	NC_016588	CCGG	2	8	17626	17633	0 %	0 %	50 %	50 %	374999510
488	NC_016588	CGC	2	6	17680	17685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999510
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499	NC_016588	GAA	2	6	18299	18304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374999510
500	NC_016588	GACG	2	8	18322	18329	25 %	0 %	50 %	25 %	374999510

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